Les CLIS accueillent des élèves selon 4 types de handicaps, correspondant à 4 options des enseignants spécialisés.
- CLIS 1 : troubles importants des fonctions cognitives (une CLIS 1 est implantée dans la circonscription à l'école polyvalente 11 rue Pajol, 18e)
- CLIS 2 : déficience auditive grave ou une surdité
- CLIS 3 : déficience visuelle grave ou une cécité
- CLIS 4 : déficience motrice, des difficultés d’apprentissage en liaison avec une maladie chronique invalidante.